Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms