Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms