Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms