Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms