Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms