Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms