Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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COPS7AQ9UBW8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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COPS7AQ9UBW8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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COPS7AQ9UBW8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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