Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms