Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms