Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MMP26Q9NRE1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms