Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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