Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KIAA1549Q9HCM3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms