Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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