Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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