Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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FOXQ1Q9C009 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXQ1Q9C009 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXQ1Q9C009 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXQ1Q9C009 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FOXQ1Q9C009 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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FOXQ1Q9C009 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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FOXQ1Q9C009 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXQ1Q9C009 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
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