Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP1Q9C000 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms