Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM31Q9BZY9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms