Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms