Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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