Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP9Q99956 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms