Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms