Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms