Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBE2E3Q969T4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBE2E3Q969T4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBE2E3Q969T4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBE2E3Q969T4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBE2E3Q969T4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBE2E3Q969T4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBE2E3Q969T4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBE2E3Q969T4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBE2E3Q969T4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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UBE2E3Q969T4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBE2E3Q969T4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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