Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RNF34Q969K3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RNF34Q969K3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RNF34Q969K3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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