Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms