Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2A3Q93084 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms