Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms