Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms