Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SCG3Q8WXD2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SCG3Q8WXD2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SCG3Q8WXD2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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