Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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COPS9Q8WXC6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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COPS9Q8WXC6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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COPS9Q8WXC6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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