Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms