Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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