Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms