Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms