Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTF1AQ7RTS3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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