Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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