Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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