Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms