Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETSATQ6NUM9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms