Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms