Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FAM208BQ5VWN6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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