Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP350Q5VT06 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms