Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 HNRNPCP3-201ENST00000560385 875 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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C4orf48Q5BLP8 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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C4orf48Q5BLP8 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 FAM153C-213ENST00000620373 1048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TXN2-201ENST00000216185 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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C4orf48Q5BLP8 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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C4orf48Q5BLP8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 DNAAF4-203ENST00000448430 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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C4orf48Q5BLP8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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C4orf48Q5BLP8 PPP1CC-204ENST00000546933 2154 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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C4orf48Q5BLP8 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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C4orf48Q5BLP8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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C4orf48Q5BLP8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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C4orf48Q5BLP8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C4orf48Q5BLP8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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