Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms