Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms