Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q499Y3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q499Y3 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q499Y3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q499Y3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q499Y3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q499Y3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q499Y3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q499Y3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q499Y3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q499Y3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q499Y3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms