Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP19-7Q3SYF9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms