Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TTLL9Q3SXZ7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TTLL9Q3SXZ7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTLL9Q3SXZ7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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