Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms