Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms